Hay muchas bacterias en el agua, algunas son beneficiosas y otras son dañinas. Las bacterias en el agua se pueden dividir en dos grupos principales, las bacterias aerobias y las bacterias anaerobias. Las bacterias aerobias requieren oxígeno para vivir, mientras que las bacterias anaerobias no pueden vivir en presencia de oxígeno. Las bacterias anaerobias son las que se encuentran en las aguas estancadas y son las que causan el mal olor. Las bacterias aerobias son las que se encuentran en los ríos y lagos y son las que se encargan de la descomposición de la materia orgánica. Las bacterias son muy importantes para el ciclo del agua, ya que ayudan a purificar el agua y mantenerla limpia. Sin las bacterias, el agua se volvería estancada y maloliente. Las bacterias también son importantes para la salud de los peces, ya que ayudan a digerir la comida y eliminar los residuos.
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